自动化系戴琼海院士基金委重大仪器团队发文报道计算摄像显微新进展
清华新闻网7月10日电 7月8日,清华大学自动化系戴琼海院士领衔的国家自然基金委重大仪器研制团队在多维多尺度高分辨率计算摄像显微仪器研制和生命科学观测领域取得重要成果,以“视频帧率下厘米尺度微米分辨率的生物动态成像”(Video-rate imaging of biological dynamics at centimeter-scale and micrometer-resolution)为题,在线发表于《自然·光子学》(Nature Photonics)上。
图1.曲面排列的大规模高密度相机阵列实现亿级像素的动态视频观测,探索哺乳动物全脑神经活动
显微仪器是生命科学和医学研究中不可或缺、无法替ㄨ代的重要工具。具有高时空分辨率的大尺度生物活动显微成像对于系统生物学研究是不可或缺的。然而,传统显微仪器长期受制于视场与分辨率此消彼长的固有矛盾和数据通量瓶颈难题,无法兼顾宽视场和高时空分辨率,制约了生命科学基础研究和临床医学研究的发展。
在这项研究工→作中,团队将光学、微电子、计算机视觉以及信号处理等学科交叉,提出了多尺度曲面中继协同显微成像新架构:通过物方平场像方曲↓场的物镜将样本放大到曲面中继像,像感器阵列分区域同步并行拍摄中继像近似平场的小区域,经计算重建为无缝的宽视场高分辨率动态图像序列。基于此架构,研制了“实时超宽场高分辨率成像显微镜”(Real-time, Ultra-large-Scale, imaging at High-resolution macroscope,RUSH),兼具1厘米×1.2厘米超宽视场、全视场均一的1.2微米高分辨率、30帧每秒高帧率,数据通量高达51亿像素每秒。
图2.(a)RUSH成像示意图及采集重建过程;(b)RUSH视场10毫米×12毫米,可覆盖整个小鼠全脑;(c)全视场不同区域分辨率分布图,平均分辨率为1.30±0.08微米,反卷积后达1.2微米
这项工作通过清醒小鼠在体全脑皮层成像等生命科学实验,对以宽场高分辨动态成像为基础的脑动态网络结构、神经血管耦合机制、癫痫病理进行了探索。这项工作为生命科学和医学研究亟需的显微仪器研制提供了新思路。该研究工作得到国家自然科学基金重大⊙仪器专项、北京市科委等项目资助。
图3.小鼠全脑皮层神经活动动态成像结果
论文共同第一作者为清华大学自动化系范静涛副研究员、索津莉副教授、2014级博士生吴嘉敏、谢浩助理研究员,清华大学为论文第一单位。论文共同通讯作者为清华大学自动化系戴琼海院士、精仪系孔令杰副教授和浙江大学现代光学仪器国家重点实验室郑臻荣教授。
论文链接:
https://www.nature.com/articles/s41566-019-0474-7
供稿:自动化系
编辑:李华山
审核:周襄楠
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